新农合主要报销住院费用，是因为其设计初衷是解决农民重大疾病的经济负担，通过统筹账户集中资金应对高额医疗支出，而门诊费用因起付线高、报销比例低，更适合由个人承担或基层医疗机构解决。

1. 保障重点在重大疾病

新农合的核心功能是覆盖住院等大额医疗支出，尤其是大病救治，报销比例可达30%-60%（不同医院级别），避免农民因高额费用放弃治疗。相比之下，门诊多为小病小痛，费用较低，个人承担压力较小。

2. 资金有限，优先统筹

新农合资金主要来自集体统筹和政府补助，需优先保障住院等刚性需求。若覆盖门诊，可能因资金分散导致大病保障不足，且门诊起付线（如300元以下仅报30%）实际报销金额有限，意义不大。

3. 简化管理，避免滥用

住院需提供诊断证明、费用清单等严格凭证，便于审核真实性。若开放门诊报销，可能增加虚假诊疗风险，加重管理成本，反而不利于资金高效使用。

4. 基层医疗分流小病

村卫生室或镇卫生院门诊报销比例较高（40%-80%），鼓励农民小病在基层解决，既减轻个人负担，也缓解大医院压力，形成分级诊疗的良性循环。

总结：新农合聚焦住院报销是权衡资金效率与保障需求的合理设计，未来随着筹资水平提高，门诊保障或逐步优化，但现阶段仍以“保大病”为核心。