根据2023年个人所得税法规定，山西晋城社保基数为6800元时，扣除五险一金后的应纳税所得额及个税计算如下：

一、扣除项目与起征点

1. 起征点 ：2023年个人所得税起征点为5000元；

2. 社保扣除 ：需扣除五险一金（具体比例因单位而异，假设单位按国家最低标准缴纳）。

二、应纳税所得额计算

应纳税所得额 = 工资收入 - 社保缴费金额 - 起征点

（注：由于社保缴费金额未明确，需根据单位实际缴纳金额计算）

三、个税计算示例

假设单位缴纳社保及公积金后，实际到手工资为6000元（即6800元扣除五险一金后）：

1. 应纳税所得额 = 6000元 - 5000元（起征点）= 1000元 ；

2. 适用税率 ：根据2023年税率表，1000元属于3%税率区间；

3. 速算扣除数 ：3%税率对应的速算扣除数为0；

4. 应纳税额 = 1000元 × 3% - 0 = 30元 。

四、注意事项

1. 实际扣税金额需结合单位具体缴纳的社保金额计算，不同单位可能存在差异；

2. 若扣除社保后应纳税所得额为负数，则无需缴税；

3. 若扣除后收入低于6000元（即6800元起征点），则直接免征个税。

建议通过单位财务部门或税务机构获取准确的社保缴费明细，以便精确计算个税。