收到医保中心结算款的会计分录需根据款项性质和结算阶段进行具体处理，主要分为以下几种情况：

一、实际结算时（医保中心直接付款）

1. 完全结算已发生费用

   若医保款仅用于结算已发生的医疗服务费用，会计分录为： $$借：银行存款/现金 \quad 贷：应收账款（医保款）$$

   目的：将应收账款转为现金或银行存款。

2. 部分预收部分结算

   若收到的医保款包含预收金额和已结算金额，则需拆分处理： $$借：银行存款 \quad 贷：应收账款（医保款） \quad 预收账款$$

   例如：收到100万元，其中80万元为已结算费用，20万元为预收金额。

二、医保结算产生差额时

当医保实际支付金额与医院应收金额存在差额时，需通过“事业收入—医疗收入—结算差额”科目核算：

1. 确认应收医疗款与结算差额 $$借：应收账款—应收医疗款—应收医保款 \quad 贷：应收账款—应收医疗款—应收医保款（调整后金额）$$

   例如：应收100万元，医保实际支付95万元，差额5万元需计入结算差额。

2. 实际收到医保款时 $$借：银行存款 \quad 坏账准备 \quad 结算差额 \quad 贷：应收账款—应收医疗款—应收医保款$$

   例如：收到95万元，坏账准备1万元，结算差额4万元。

三、注意事项

1. 医保拒付处理

   因违规等原因被拒付的金额需通过“坏账准备”科目核算，实际结算时冲减。

2. 明细核算建议

   医院可通过设置明细科目（如按医保类型）进行核算，但实际操作中常因信息不对称通过备查簿登记。

3. 地区差异

   具体会计处理可能因地区会计准则不同存在差异，建议结合当地政策调整。

以上分录示例均以医院为例，其他类型企业（如商业保险公司）需根据自身业务性质调整科目设置。