辽宁合作医疗在吉林可以报销，但需满足跨省就医联网结报条件，且报销比例可能低于本地。 具体需提前办理异地就医备案，并选择吉林的定点医疗机构才能直接结算，否则需先垫付后回辽宁报销。

1. 报销条件与流程
   辽宁与吉林已签订新农合跨省就医联网结报协议，参保人员需在辽宁办理异地就医备案手续，并在吉林的12家定点医疗机构就诊方可直接结算。若未备案，需保留所有医疗票据，回辽宁参保地医保中心申请手工报销，流程相对繁琐。

2. 报销比例差异
   跨省报销比例通常低于辽宁省内标准，具体比例由辽宁当地政策规定，一般会扣除一定比例的“异地就医调节金”。例如，住院费用可能按50%-70%报销，而门诊报销范围更有限。

3. 所需材料与注意事项
   直接结算需携带社保卡、身份证及辽宁医保部门开具的转诊证明。手工报销则需提供病历、费用清单、发票原件等。注意：急诊可先就医后补备案，但需在3个工作日内联系参保地医保部门报备。

4. 特殊情形处理
   孕产妇分娩、大病专项救治等特殊情况，可优先享受跨省结算服务，部分地区还支持线上备案（如“辽事通”APP）。但美容、整形等非治疗性项目不在报销范围内。

建议提前通过辽宁医保局官网或热线查询最新政策，确保就医医院在联网结算名单内，避免因材料不全或流程不符影响报销。