医保卡超额支付通常源于以下几个原因：

1. 医疗费用超出报销范围：医保卡支付额度受限于医保政策规定的报销范围和比例。当医疗费用中包含超出医保报销范围的项目或药品时，即使卡内余额充足，也会因不符合报销条件而无法支付。

2. 年度或终身支付限额：医保卡通常设有年度或终身支付限额，超过该限额后，医保将不再承担费用。即使卡内仍有余额，系统也会提示超额支付。

3. 个人账户余额不足：医保卡个人账户余额不足时，即使医疗费用在报销范围内，也会因卡内余额不足而无法完成支付。

4. 医院系统或网络问题：有时，医院的医保结算系统或网络可能出现故障，导致医保卡支付失败，出现超额支付的情况。

5. 重复或错误计费：医院在计费过程中可能出现重复计费或错误计费的情况，导致医疗费用超出实际应支付金额，从而出现超额支付。

6. 异地就医未备案：如果在非参保地就医且未进行异地就医备案，可能会导致医保卡无法正常使用或支付受限，从而出现超额支付的情况。

总结：医保卡超额支付可能是由于医疗费用超出报销范围、年度或终身支付限额、个人账户余额不足、医院系统或网络问题、重复或错误计费以及异地就医未备案等原因造成的。如遇此类情况，建议及时与医院或医保部门沟通，以解决问题。