异地住院合作医疗报销流程可分为以下步骤，综合各地政策整理如下：

一、转诊备案

1. 办理转诊手续

   患者需携带身份证、新农合医疗证、病历复印件、诊断证明等材料，到参保地县合管办办理转诊备案。部分城市支持电话、网络或现场办理。

2. 确认转诊医院

   选择参保地公布的异地定点医疗机构，确保其已纳入医保报销范围。部分城市实行直接结算，未纳入的需垫付费用。

二、异地就医

1. 选择定点医院

   携带转诊证明及新农合医疗证到转诊医院办理住院手续，选择医保定点医疗机构以享受直接结算。

2. 费用垫付

   若医院不支持直接结算，患者需先垫付医疗费用。部分城市对私立定点医院有特殊报销政策。

三、出院报销

1. 准备报销材料

   出院后需携带身份证、新农合医疗证、病历复印件、住院结算单、费用清单及转诊备案手续。

2. 提交报销申请

   将材料提交至参保地医保经办机构，部分地区支持线上提交。材料审核通过后，医保将按比例报销。

3. 结算方式

   • 直接结算 ：部分城市（如省级直补医院）支持出院时直接刷卡结算。

   • 回参保地报销 ：多数地区需患者回户籍地或参保地合管办办理报销，部分城市允许委托他人代办。

四、注意事项

1. 报销比例差异

   不同地区、医院等级及费用类型（如起付线、封顶线）会影响报销比例，建议提前咨询参保地医保部门。

2. 特殊情况处理

   • 未办理转诊的异地就医可能影响报销，需先完成备案。

   • 外地长期居住人员需根据当地政策办理异地转移接续手续。

五、法律依据

新型农村合作医疗的报销依据为《中华人民共和国社会保险法》第二十三条、第二十四条，职工医保同台统筹后，相关待遇标准按国家统一执行。