生育津贴的发放与社保自费部分的关系需要根据具体情况区分处理，具体说明如下：

一、生育津贴与社保的关系

1. 生育津贴与单位社保不冲突

   生育津贴是生育保险待遇的一部分，由生育保险基金支付，与单位为员工缴纳的社保（如医疗保险、养老保险等）并行不悖。单位无需从生育津贴中扣除已缴纳的社保费用。

2. 个人社保缴费的处理

   • 若员工生育期间单位已正常缴纳社保且个人部分已按时扣缴，则生育津贴到手时无需再扣除个人社保缴费部分。

   • 若生育期间单位未缴纳社保或个人部分未扣缴，则需从生育津贴中扣除相应的个人缴费金额。

二、特殊情况说明

1. 工资与津贴的发放标准

   生育津贴的发放以产假工资为基础，若产假工资高于生育津贴，则按产假工资发放；若产假工资低于生育津贴，则先发放产假工资，差额部分由用人单位补足。

2. 公积金的处理

   生育津贴期间单位无需再为员工缴纳住房公积金，但员工个人缴纳的公积金部分不会从生育津贴中扣除。

三、争议解决途径

若单位拒绝支付或存在其他争议，员工可通过以下方式维权：

• 协商解决 ：与单位协商调整发放方式；

• 劳动仲裁 ：向当地劳动仲裁委员会申请仲裁；

• 社保投诉 ：向社保部门投诉或咨询法律专业人士。

生育津贴的发放无需扣除单位已缴纳的社保，但需注意个人缴费部分的处理规则，建议员工与单位明确约定相关条款以减少纠纷。