新生儿应优先选择办理医保，而不是新农合，具体原因如下：

1. 医保报销范围更广

医保报销范围覆盖城镇和农村居民，而新农合主要面向农村地区。医保报销范围更广，包括住院、门诊、药品等多种费用，且报销比例通常高于新农合。

2. 报销政策更灵活

医保政策允许新生儿在出生后3个月内参保，且自出生之日起的医疗费用可纳入报销范围。例如，重庆医保政策明确表示，新生儿出生后90天内参保，可享受“落地即保”，即医疗费用即时结算。

3. 线上办理更便捷

目前医保已支持线上办理，家长只需提供出生证明，通过微信小程序即可完成参保，无需等待户口本。而新农合通常需要前往当地经办机构办理，流程相对繁琐。

4. 医保待遇更高

医保参保后，新生儿可享受未成年人报销比例提高5个百分点等优惠，而新农合的报销比例相对较低，且保障范围有限。

5. 新生儿医保的即时保障

医保政策规定，新生儿出生后即可获得医疗保障，有效避免了医疗费用无法报销的空白期。而新农合的参保时间通常与下一年度筹资挂钩，可能导致部分费用无法报销。

总结

新生儿应优先选择医保，其报销范围广、政策灵活、线上办理便捷，且保障力度更高。若新生儿为农村户籍且符合新农合条件，可同时参保，但医保仍是首选保障方式。