公司保险（职工医保）和农村医保（新农合）在参保资格、缴费主体、待遇享受等方面存在根本性差异，根据相关法律规定和制度设计，两者不能同时参保。以下是具体分析：
一、参保资格与覆盖范围
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职工医保 ：覆盖城镇职工及灵活就业人员，需由用人单位和职工共同缴费，属于强制参保制度。
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农村医保 ：仅限农村户籍人员（农业户口）自愿参保，由政府补贴、集体扶持和个人缴费组成。
二、缴费主体与缴费标准
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职工医保 ：用人单位缴费率约6%，职工个人缴费率2%，资金来源于单位与个人共同承担。
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农村医保 ：个人缴费标准因地区而异（如每年100-500元），无单位缴费部分。
三、待遇享受原则
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报销冲突 ：两者均属于医疗保险范畴，但根据《社会保险法》规定， 只能享受其中一种待遇 ，无法同时报销。
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参保选择 ：若已参加职工医保，则需停止缴纳农村医保；若参加农村医保，则需办理职工医保注销手续。
四、其他注意事项
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缴费时间 ：职工医保按月缴纳，农村医保通常按年缴纳，时间节点不同。
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报销比例差异 ：职工医保报销比例较高（含个人账户），农村医保报销比例较低且无个人账户。
总结
由于两种医保制度在参保对象、资金来源、待遇标准等方面存在本质区别，且法律规定 只能选择其中一种 ，因此公司保险（职工医保）与农村医保无法同时缴纳或使用。建议根据户籍性质和就业情况选择合适的医疗保障方式。
