基本医疗保险与合作医疗不是同一事物，两者在覆盖范围、缴费方式、保障对象等方面存在显著差异。具体区别如下：
一、覆盖范围不同
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基本医疗保险
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覆盖城镇职工（包括企业职工、机关事业单位人员等）和城乡居民（包括城镇非从业居民和农村居民）。
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城镇职工医保由单位缴费和个人缴费共同承担，城乡居民医保则由个人缴费和政府补贴组成。
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合作医疗（原新农合）
- 仅覆盖农村居民，属于新型农村合作医疗制度。
二、缴费方式与资金来源不同
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基本医疗保险 ：
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城镇职工医保：单位缴费比例通常为6%-12%，个人缴费8%-2%；
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城乡居民医保：个人缴费比例约2%-12%，政府补贴占比较大。
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合作医疗 ：
- 主要由个人缴费（约30%-50%）和集体扶持（约30%-50%）组成，无政府财政补贴。
三、保障内容与报销标准不同
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基本医疗保险 ：
- 覆盖门诊、住院、重大疾病等，报销比例较高（如门诊报销50%-70%），设有起付线、封顶线等机制。
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合作医疗 ：
- 以大病统筹为主，报销比例较低（如乡镇医院报销70%-80%，大医院仅50%-60%），封顶线也低于城镇医保。
四、管理主体与系统不同
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城镇职工医保由社保系统管理；
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城乡居民医保由卫生局或医疗保障部门管理。
五、政策整合趋势
根据国家医疗保障体制改革，新型农村合作医疗（新农合）已与城镇居民基本医疗保险（城居保）合并为 城乡居民医保 ，覆盖范围扩展至全体城乡居民，但两者在制度设计上仍存在差异。目前，若已参加城镇职工医保，则无需再参加城乡居民医保。
总结 ：基本医疗保险是覆盖城镇职工及城乡居民的综合性医疗保障制度，而合作医疗（原新农合）是专门针对农村居民的医疗保障制度。两者在多个维度存在本质区别，且已通过政策整合形成城乡居民医保的统一体系。
