户口迁移后合作医疗的迁移流程如下：

一、停止原参保地医保

1. 单位办理

   若原参保地有接收单位，由单位办理医保转移手续。

2. 个人办理

   若无接收单位，需在终止原基本医疗保险关系后3个月内参保缴费。

二、办理医保转移手续

1. 准备材料

   需携带身份证、户口本、社保卡及原参保地医保机构开具的转移证明（需3个月内有效）。

2. 提交申请

   将上述材料提交至新户籍地社保部门，办理医保关系转移。

三、新户籍地参保

1. 自动转移

   若新户籍地医保政策允许自动转移，材料审核通过后即可享受新户籍地医保待遇。

2. 手动参保

   若需手动参保，需到新户籍地社保部门办理参保登记，按当地缴费标准缴纳保费。

四、注意事项

1. 缴费时间

   原参保地医保通常在次月1日终止，新参保地医保需按时缴费后次月1日生效。

2. 政策差异

   具体转移流程可能因地区政策不同存在差异，建议提前咨询两地社保部门。

3. 特殊情况处理

   • 农村合作医疗（新农合）通常随户籍迁移自动转移，无需额外办理；

   • 城镇医保需在迁入地重新参保。

五、法律依据

根据《中华人民共和国户口登记条例》及社保政策规定，公民迁移后医保关系应随户籍转移，确保在迁入地依法享有医疗保障权益。