当肥料抽检不合格时，需根据相关法律法规和监管要求采取以下措施：

一、立即停止销售与召回

1. 停止生产与销售 ：相关监管部门会责令企业立即停止该批次不合格肥料的生产和销售，防止问题产品继续流入市场。

2. 封存与标识 ：对不合格产品进行封存，并明确标注“不合格”标识，避免与合格产品混淆。

3. 召回已售产品 ：对已售出的不合格肥料进行召回，采取退货、换货或赔偿等措施。

二、依法处罚与整改

1. 行政处罚 ：

   • 罚款 ：根据《产品质量法》规定，对违法所得3倍以下罚款，但最高不超过3万元；无违法所得的，罚款不超过1万元。

   • 没收违法所得与罚款 ：若存在违法所得，将一并没收。

   • 吊销营业执照 ：情节严重的，吊销营业执照。

2. 刑事追责 ：若涉及犯罪行为（如生产、销售有毒有害肥料），将依法移交司法机关追究刑事责任。

三、整改与复查

1. 原因分析与整改 ：企业需针对不合格原因进行整改，如改进生产工艺、加强质量检测等，并提交整改报告。

2. 复检与恢复生产 ：整改后需申请复检，合格后方可恢复生产和销售。

四、消费者权益保护

1. 赔偿措施 ：因使用不合格肥料造成损失的消费者，可通过协商、调解或诉讼要求赔偿。

2. 信息公示 ：企业需主动公开不合格产品信息，配合监管部门调查。

五、部门协同与追溯

1. 跨部门协作 ：农业、市场监管、公安等部门需联合行动，查处生产、流通环节的违法行为。

2. 追溯机制 ：建立肥料来源、流向追溯体系，及时发现并控制问题产品扩散。

以上措施需在规定的时间内完成，逾期不处理的，将面临更严厉的处罚。建议企业主动配合监管部门工作，避免因小失大。