药品监督管理部门在监督检查中拥有以下职权，综合多部门职责规定整理如下：

一、现场检查与延伸检查权

1. 进入现场实施检查

   可对药品研制、生产、经营及使用单位进行现场检查，包括生产车间、仓储设施等。

2. 延伸检查权

   对有证据证明可能存在安全隐患的环节，可延伸检查相关单位和个人，被检查单位和个人需配合。

二、抽样检验与行政强制措施权

1. 抽样检验权

   根据需要对药品质量进行抽查检验，抽样应符合法定程序且不得收取费用。

2. 查封扣押权

   对有证据证明可能危害人体健康的药品、原料、设备或违法工具、设施进行查封、扣押，并在7日内作出处理决定。

三、行政处理与追溯权

1. 行政处理权

   对查封、扣押的物品进行检验后，可依法作出没收、罚款、吊销许可证等处理决定。

2. 追溯权

   负责药品、医疗器械注册后的跟踪检查，确保持续符合法规要求。

四、信息管理与保密义务

1. 信息管理权

   可查阅、复制相关合同、票据、账簿等资料，建立监督检查档案。

2. 保密义务

   对知悉的技术秘密和商业秘密负有保密责任，未经被检查单位同意不得泄露。

五、其他职权

1. 行政处罚权

   对违反药品管理法规的行为依法进行处罚，包括罚款、吊销执照等。

2. 应急处理权

   组织协调食品药品安全事故的应急处置和调查处理工作。

3. 政策制定权

   参与制定药品、医疗器械质量标准和管理规范，并监督实施。

以上职权均需依法履行，检查时需出示证明文件。若单位或个人拒绝配合，监管部门可依法采取强制措施。