根据搜索材料和我的知识，以下是一些在吉林市治疗夜间咳嗽比较好的医院推荐：

1. 1.吉林市中心医院：简介：吉林市中心医院是吉林地区规模最大、综合实力最强的三级甲等医院，集医疗、科研、教学、预防保健、康复于一体推荐理由：该医院在呼吸内科方面有丰富的经验和专业的医生团队，能够提供高质量的医疗服务
2. 2.吉林市人民医院：简介：吉林市人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健为一体的综合性三级甲等医院推荐理由：该医院在呼吸内科方面有多个专家，特别是在慢性咳嗽和呼吸系统疾病的治疗上有丰富的经验
3. 3.吉林省吉林中西医结合医院：简介：这是一所集医疗、科研、教学和预防保健于一体，具有中西医结合特色优势的三级甲等综合性医院推荐理由：该医院采用中西医结合的方式治疗呼吸系统疾病，如慢性咳嗽、支气管炎等
4. 4.吉林市骨伤医院：简介：吉林市骨伤医院提供全年24小时开诊服务，并且有夜间延时出诊服务。推荐理由：如果您夜间需要紧急就医，该医院是一个不错的选择，能够提供及时的医疗服务。
5. 5.吉林国盛弘医堂中医医院：简介：该医院提供24小时发热门诊服务，并且在中医诊疗方面有丰富的经验。推荐理由：如果您倾向于中医治疗，该医院可以提供专业的诊疗服务。
6. 6.吉林省妇幼保健院中医诊疗中心：简介：该中心提供夜诊服务，时间为周一至周日晚间。推荐理由：如果您需要夜间的中医诊疗服务，该中心是一个不错的选择。

这些医院在治疗呼吸系统疾病和夜间咳嗽方面都有丰富的经验和专业的医疗团队。您可以根据自己的具体需求和地理位置选择合适的医院进行就诊。建议在就诊前通过电话或网络进行预约，以便更好地安排就诊时间。