常用内参基因包括但不限于以下几种：
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GAPDH：GAPDH是甘油醛-3-磷酸脱氢酶的英文缩写。该酶基因为管家（housekeeping）基因，几乎在所有组织中都高水平表达，在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的，且不受含有的部分识别位点、佛波脂等的诱导物质的影响而保持恒定，故被广泛用作抽提totalRNA、poly(A)+RNA、Westernblot等实验操作的标准化的内参。
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β-actin：β-actin一般指肌动蛋白，是一类形成微丝的球状多功能蛋白质。它基本上存在于所有真核细胞中，其中它可以以超过100μM的浓度存在；其质量约为42kDa，直径为4至7nm。β-actin的氨基酸序列也是最高度保守的蛋白质之一，因为它在进化过程中几乎没有变化。
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18SrRNA和28SrRNA：rRNA即核糖体RNA，它由不同于mRNA合成的RNA聚合酶所合成。因此rRNA合成的调节独立于mRNA。通常在影响mRNA表达的条件下，各种rRNA水平很少发生变化。
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tubulin：组成微管的蛋白质称为微管蛋白。微管蛋白是球形分子，有两种类型：α微管蛋白（α-tubulin）和β微管蛋白（β-tubulin），这两种微管蛋白约占微管蛋白总量的80%~95%，具有相似的三维结构，能够紧密地结合成二聚体，作为微管组装的亚基。
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snRNA和snoRNA：small nuclear RNA (snRNA)和small nucleolar RNA (snoRNA)长度与miRNA相近，200bp左右，在多种组织细胞中高表达，不涉及miRNA的调节途径，且与miRNA探针设计方法相同。
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UBC和HMBS：有研究学者对67例肝组织研究，发现UBC（泛素）和HMBS（胆色素原脱氨酶）对于肝组织的表达分析是最佳选择。
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16SrRNA：在以Lactobacillus helveticus H9为研究对象的研究中，通过对多种内参基因的表达稳定性进行评价，结果表明16SrRNA是表达相对稳定的基因之一。
以上基因是在不同实验条件下常用的内参基因，但需要注意的是，并没有一种内参基因能够在所有条件下都保持稳定表达。在具体实验中，应根据研究目的、样本类型和实验条件等因素，选择最适合的内参基因。