高脂蛋白血症如果未经及时有效治疗，导致了并发症的发生，可能会留下一些后遗症。但若发现早、治疗及时，一般不会有后遗症。以下是可能出现的后遗症：
- 心血管系统
- 冠心病：长期的高脂蛋白血症可促使冠状动脉粥样硬化，使冠状动脉狭窄或阻塞，心肌供血不足。即使经过治疗，已形成的冠状动脉粥样斑块也可能仍然存在，导致患者在劳累、情绪激动等情况下，仍有心绞痛发作的可能。严重时，可能会发生心肌梗死，部分心肌细胞因缺血缺氧而坏死，影响心脏的收缩和舒张功能，进而引发心力衰竭等后遗症。
- 脑卒：高脂蛋白血症会导致脑动脉粥样硬化，增加脑梗死的发生风险。发生脑梗死时，局部脑组织因缺血而受损，即使经过治疗，患者也可能会遗留肢体偏瘫、言语不利、认知障碍等后遗症，影响生活质量和自理能力。
- 消化系统：严重的高脂蛋白血症，如家族性脂蛋白脂酶缺陷症和家族性载脂蛋白 CⅡ 缺陷症患者，可因乳糜微粒栓子阻塞胰腺毛细血管，导致急性胰腺炎。急性胰腺炎如果病情严重，可能会引起胰腺组织的坏死、感染等，即使病情得到控制，也可能会导致胰腺功能受损，出现慢性胰腺炎、胰腺假性囊肿等后遗症，影响消化和吸收功能，患者可能会出现腹痛、腹泻、脂肪泻、营养不良等症状。
- 泌尿系统：脂质可在肾小球细胞内或系膜基质中沉积，并发生氧化修饰，导致肾小球上皮细胞损害、基底膜通透性增加，出现蛋白尿。长期的蛋白尿会进一步损伤肾脏功能，最终可发展为慢性肾衰竭，患者需要依靠透析或肾移植来维持生命。
不过，如果高脂蛋白血症患者能够早期发现，并通过积极的生活方式调整（如低脂饮食、适量运动、戒烟限酒等）和药物治疗等综合措施，将血脂控制在理想范围内，就可以有效减少并发症的发生，从而避免出现上述后遗症。
