锦州市内治疗肩膀疼痛伴头痛的医院选择可参考以下分类推荐：

一、综合医院推荐

1. 锦州市中心医院

   • 三级甲等综合医院，拥有丰富的疼痛诊疗资源，疼痛科及神经内科可提供多学科协作诊疗。

2. 辽宁医学院附属第三医院（锦州分院）

   • 三甲综合医院，设有60个科室，157位医生，疼痛科在锦州地区具有较高知名度。

二、专科医院推荐

1. 锦州市中医医院

   • 中医特色鲜明，擅长运用针灸、推拿等疗法结合中药治疗疼痛类疾病，对肩周炎、颈肩痛有较好效果。

2. 锦州市血管性偏头痛医院（未明确名称）

   • 专注于难治性头痛（包括偏头痛、丛集性头痛等），若头痛与血管问题相关，可优先考虑。

三、其他选择建议

• 社区卫生服务中心 ：适合初步诊断和康复指导，但需结合复杂症状选择专业机构。

• 康复医院/疼痛专科医院 ：部分医院设有专门的疼痛康复科，可针对术后或慢性疼痛提供专业管理。

四、就医前注意事项

1. 明确病因 ：肩痛伴头痛可能涉及肌肉骨骼问题、神经压迫或内科疾病，建议初步检查（如X光、MRI）。

2. 预约挂号 ：可通过医院官网或平台（如名医汇）预约专家号源。

3. 综合评估 ：部分医院需结合多学科会诊制定个性化治疗方案。

如需进一步筛选，可结合医院评分、科室设置及患者评价综合判断。