职工医保中单位缴纳的部分不会清零，具体说明如下：

一、单位缴费的性质与账户关系

1. 单位缴费属于统筹基金

   职工医保由个人账户和统筹基金两部分组成，其中单位缴纳的部分属于统筹基金，用于支付参保人员的大额医疗费用（如住院、门诊等）。

2. 与个人账户独立

   统筹基金和个人账户是两个独立的账户体系，单位缴纳的资金不会直接进入个人账户，因此不存在单位缴费清零的情况。

二、账户余额的运作规则

1. 年度结算与连续性

   • 统筹基金每月进行结算，但账户余额不会清零。例如，某职工6月停保，当年6月的统筹基金余额会结转到下一年度继续使用。

   • 个人账户同样具有年度续期功能，未使用的金额会自动转入下一年度，无需手动操作。

2. 缴费中断的影响

   • 若职工连续断缴医保超过6个月，将无法使用统筹基金报销医疗费用，但个人账户中的资金（如药品、门诊等小额支出）仍可正常使用。

三、特殊情况说明

• 退休待遇 ：达到法定退休年龄且累计缴费年限符合规定后，职工无需再缴纳医保费，但可继续享受医保待遇，统筹基金和个人账户均不会清零。

• 医保档次调整 ：职工医保档次的调整（如从一档转为二档）不会影响个人账户的累计余额，参保时间也不会重新计算。

职工医保中单位缴纳的部分作为统筹基金，其账户余额不会清零，而是实现年度续期和连续使用。