基底核钙化症的晚期症状主要表现为多系统功能受损，具体包括以下方面：

一、运动障碍加重

1. ‌帕金森综合征‌：肌强直、运动迟缓、静止性震颤等典型症状显著加重，可能伴随姿势步态异常‌。
2. ‌不自主运动‌：手足徐动症可能逐渐消失，但扭转痉挛、舞蹈样动作等持续存在或加重‌。
3. ‌共济失调‌：步态蹒跚、平衡能力下降，甚至完全丧失自主行走能力‌。

二、精神与认知功能严重衰退

1. ‌痴呆‌：记忆力、定向力、语言能力全面减退，生活无法自理‌。
2. ‌精神障碍‌：出现幻觉、谵妄、攻击行为、情感淡漠等，部分患者可能合并抑郁或躁狂‌。
3. ‌智力低下‌：表现为思维迟缓、反应迟钝，甚至完全丧失交流能力‌。

三、其他神经系统并发症

1. ‌癫痫‌：发作频率增加，可能出现难治性癫痫‌。
2. ‌构音障碍‌：语言功能严重受损，无法清晰表达‌。
3. ‌自主神经功能障碍‌：如吞咽困难、二便失禁等‌。

四、全身性症状

1. ‌代谢异常‌：低钙血症相关症状（如手足抽搐）可能持续存在，尤其合并甲状旁腺功能异常者‌。
2. ‌慢性头痛/眩晕‌：因脑组织长期受损或钙化灶压迫引起‌。

‌注‌：晚期症状个体差异较大，部分患者可能以某一类症状（如精神障碍或运动障碍）为主导，需结合影像学及实验室检查综合评估‌。