福建有许多医院可以治疗腹痛伴腹泻，以下是一些较为知名的医院：
- 福建医科大学附属第一医院：作为福建省的大型综合性医院，其消化内科等相关科室在消化系统疾病的诊断和治疗方面具有丰富的经验和先进的技术，拥有一批专业的医疗团队，能够针对腹痛伴腹泻的各种病因进行准确诊断和有效治疗。
- 福建省立医院：医院的消化内科实力较强，设有便秘和肠易激综合症专病门诊等，有多位擅长诊治胃肠、肝胆胰疾病的医生，可对腹痛伴腹泻等消化系统常见病多发病进行诊疗。
- 福建中医药大学附属第二人民医院：是一所集医疗、教学、科研为一体的综合性中医医院，在中医脾胃病的治疗方面有独特优势，采用中西医结合的方法，对于一些功能性胃肠疾病、肠道感染等引起的腹痛伴腹泻，能够通过中药调理、针灸等特色疗法进行治疗，缓解症状，调节机体功能。
- 福州市第二总医院（福州市第二医院）：医院科室设置齐全，消化内科、中医科等科室的医生在胃肠疾病的诊治方面有丰富经验，可对不明原因腹痛、腹泻等进行诊断和治疗，还能开展胃肠镜下的诊断及治疗。
- 厦门大学附属中山医院：是集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的综合性医院，消化内科在消化系统疾病的诊治方面技术精湛，对于腹痛伴腹泻的患者，能够运用先进的检查设备和治疗手段进行个体化的治疗。
福建还有许多其他医院也能够为腹痛伴腹泻患者提供优质的医疗服务，如福建医科大学附属协和医院、福建医科大学附属第二医院、泉州市第一医院、漳州市医院等。
