新疆阿拉尔市治疗腹水的医院主要是浙大邵逸夫医院新疆兵团阿拉尔医院。具体原因如下：
- 医院简介：其前身为新疆生产建设兵团第一师阿拉尔医院，是新疆兵团第一师阿拉尔市唯一一所集医疗、保健、预防、康复、急救为一体的三级甲等综合医院，为国家心血管疾病临床医学研究中心成员单位。
- 科室设置：医院内设临床科室 31 个，其中包括多个与治疗腹水相关的科室，如消化内科（可针对肝硬化等肝脏疾病引起的腹水进行诊治）、心血管内科（对心功能不全导致的腹水有相应治疗手段）、肾内科（能处理肾脏疾病引发的腹水问题）、普通外科（在涉及腹部疾病导致腹水的外科治疗方面有一定实力）、妇产科（可处理妇科相关疾病如卵巢癌等引起的腹水）等。医院还有 6 个兵团级重点专科，包括骨科、精神科、心血管内科、普通外科、妇产科、医学影像科，14 个师市级重点专科，能为腹水患者提供全面、专业的诊断和治疗服务。
- 医疗技术：作为国家区域医疗中心建设项目，依托浙江大学医学院附属邵逸夫医院的品牌、医疗技术、高端人才、科研实力和管理水平，在医疗技术方面具有一定优势，能够运用先进的诊疗技术和方法对腹水进行准确诊断和有效治疗。
阿拉尔市还有一些诊所，如阿拉尔市夏吉昌西医内科诊所、阿拉尔市周晓洲中医诊所等，可能会提供一些针对腹水的初步诊断或辅助治疗，但在综合诊疗能力和技术水平上与浙大邵逸夫医院新疆兵团阿拉尔医院存在差距。
