根据深圳地区医院专科设置及2025年最新诊疗动态，以下医院在治疗腹痛伴便秘方面具有显著优势：

一、综合型医院推荐

1. ‌深圳市人民医院‌

   • ‌消化内科‌：擅长胃肠道功能紊乱及慢性便秘的诊治，具备先进的诊疗手段和丰富的临床经验‌。
   • ‌肛肠外科‌：针对便秘相关肛肠疾病开展手术及综合治疗，技术处于国内先进水平‌。

2. ‌深圳市第二人民医院‌

   • ‌消化内科‌：设有胃肠动力检测室，对腹痛伴便秘的个体化治疗方案制定有较高水平‌。
   • ‌中医科‌：结合中医辨证施治缓解症状，尤其在慢性便秘管理方面效果显著‌。

3. ‌北京大学深圳医院‌

   • ‌消化内科‌：作为北京大学医学部附属医院，在顽固性便秘和胃肠功能性疾病诊疗中技术领先，提供全方位健康管理‌。

二、专科医院推荐

1. ‌深圳市中医院‌

   • ‌脾胃病科/针灸科‌：采用中药调理、针灸推拿等中医特色疗法，改善肠道功能紊乱引起的腹痛便秘‌。

2. ‌深圳市肛肠专科医院‌

   • 专注肛肠疾病诊疗，尤其对复杂性便秘合并腹痛病例有独到治疗方法‌。

三、其他重点科室

• ‌深圳大学总医院消化内科‌：整合结直肠肛门外科与内科资源，为急性或复杂性腹痛伴便秘患者提供多学科诊疗‌。
• ‌深圳市第六人民医院肛肠外科‌：擅长顽固性便秘的手术治疗，适合保守治疗无效的患者‌。

‌提示‌：腹痛伴便秘可能涉及胃肠功能紊乱、器质性疾病等多种病因，建议优先选择综合医院消化内科或胃肠科进行全面检查，再根据病因选择针对性治疗‌。