第三方水质检测机构的收费方式主要基于检测项目的数量和复杂程度，同时也受多种因素的影响，包括机构的资质、设备、服务种类和质量、地区差异以及市场竞争状况。以下是一些具体的收费情况：

1. 基础检测费用 ：约300-500元，涵盖pH值、浑浊度、色度等基础指标。

2. 常规检测套餐费用 ：约800-900元，包括溶解性总固体、总硬度、氯化物等常规化学指标。

3. 全面检测套餐费用 ：约1200-1500元，增加微生物指标和重金属检测。

4. 定制检测服务费用 ：根据具体需求定制，费用约3600-4000元起。

5. 高级水质检测套餐和特定项目检测 ：价格从2400-3100元不等，以及更为豪华的全项检测（97项），费用大约8000元左右。

6. 按照样品数量计费 ：一些机构可能按照样品数量来计费，这种方式较为常见，因为不同的检测项目会涉及到不同的检测方法和耗材。

7. 按照检测项目计费 ：更为常见的方式是按照检测项目来计费，因为不同的检测项目会涉及到不同的检测方法和耗材，因此收费标准会更为精准。

8. 其他费用 ：可能还包括现场采样费、样品预处理费等，具体费用根据检测项目的复杂程度和当地标准而定。

第三方水质检测机构的收费因服务类型、检测项目的数量和复杂程度等因素而异。建议您在选择检测机构时，根据自己的需求和预算进行选择，并直接联系相关机构获取准确的价格信息。