根据现有司法实践和相关法规，有案底却开具出无犯罪证明的情形可能涉及以下原因和法律界定：

一、原因分析

1. ‌未构成刑事犯罪‌
   即便存在违法行为，但若未被法院判决有罪（如案件终止调查、不起诉等），公安机关可能依据未生效刑事判决的系统记录开具证明‌。

2. ‌犯罪记录消除或封存‌
   未成年人犯罪记录依法封存、特赦免除刑罚或超过追诉时效等情形，相关记录可能被系统排除‌。

3. ‌数据覆盖范围限制‌
   无犯罪证明通常仅反映特定时间段或地域的查询结果。若犯罪记录不在当前查询范围内（如异地犯罪未联网），可能显示为“无犯罪”‌。

4. ‌系统或人为失误‌
   存在因信息未及时更新、录入错误或工作人员审核疏漏导致的证明开具错误‌。

二、法律界定

1. ‌有效证明的认定标准‌
   公安机关出具的无犯罪证明以系统登记信息为准，不包含未被录入的行政处罚或已消除的犯罪记录‌。

2. ‌虚假证明的法律后果‌
   若明知存在犯罪记录仍通过伪造材料等方式获取证明，可能构成提供虚假证明文件罪，开具单位及当事人均需承担法律责任‌。

三、处理建议

1. ‌主动核实更正‌
   向开具机构提交判决书等司法文书，要求重新核查并修正证明内容‌。

2. ‌合法救济途径‌
   若因记录消除或封存导致证明矛盾，可向司法机关申请出具《无犯罪记录情况说明》作为补充文件‌。

3. ‌拒绝违规操作‌
   不得隐瞒犯罪记录或通过非正规渠道获取证明，否则可能面临信用受损及刑事责任‌。

需注意：无犯罪证明仅反映特定时间段和地域内的刑事犯罪记录，行政处罚、治安拘留等非刑事处罚不影响其开具‌。