根据搜索结果，2025年内蒙古鄂尔多斯市在呼吸疾病治疗方面具有较高水平的医院主要包括以下机构：

一、综合医院

1. 鄂尔多斯市中心医院

• 科室信息 ：设有83个科室，555位医生，含呼吸科2位专家

• 综合实力 ：三级甲等综合医院，拥有较高医疗水平和患者评价

• 地址 ：伊金霍洛西街23号

2. 准格尔旗中蒙医医院

• 科室信息 ：二级综合医院，设有10个科室，12位医生，含呼吸科1位专家

• 特色 ：蒙医特色诊疗结合现代医学，适合特定呼吸疾病患者

二、专科医院

1. 鄂尔多斯现代泌尿专科医院

• 级别与定位 ：三级甲等专科医院，专注于泌尿系统疾病，但可能涉及相关呼吸系统诊疗

• 地址 ：东胜区伊金霍洛西街8号

三、其他相关医院

• 鄂尔多斯蒙医医院 ：二级综合医院，含呼吸科但评价较少

• 伊金霍洛旗人民医院 ：三级乙等综合医院，位于巴什新区，可提供综合医疗服务

四、建议

• 优先选择 ：若需综合实力更强的医院， 鄂尔多斯市中心医院 是首选

• 专科需求 ：若疾病与泌尿系统相关，可考虑 鄂尔多斯现代泌尿专科医院

• 信息确认 ：部分医院信息可能存在变动，建议通过医院官网或官方APP预约挂号

注：搜索结果中未提及2025年新增医院，以上信息基于2024年公开数据整理，就诊前建议通过官方渠道确认最新科室设置及专家排班。