在昌吉州，如果您需要投诉昌吉州的医院，可以选择以下几个部门进行投诉：
- 医院内部投诉部门 ：
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医患关系办公室或医务科 ：根据《医院投诉管理办法（试行）》，医院应当设立医患关系办公室或指定部门统一承担医院投诉管理工作。
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医院医保科或医院领导 ：可以直接向医院的医保科或找医院领导反映个人情况，与其进行协商维护自身利益。
- 卫生行政部门 ：
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县级人民政府卫生行政部门 ：如果发生医疗事故争议，当事人可以申请卫生行政部门处理，由医疗机构所在地的县级人民政府卫生行政部门受理。
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市、区卫生监督部门 ：可以向当地市、区卫生监督部门投诉，或者拨打卫生部门投诉电话12320。
- 其他相关部门 ：
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医政科 ：如果投诉的目标是诊所、医务室等小型机构，可以直接投诉到本县或本区的卫生局医政科，医政科的主要职责之一就是调解医疗纠纷。
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医疗纠纷人民调解委员会 ：也可以去医疗纠纷人民调解委员会进行投诉或调解。
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司法部门 ：在一些情况下，还可以选择向司法部门投诉或提起诉讼。
建议
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首先尝试内部解决 ：建议先向医院内部的医患关系办公室、医务科或医保科投诉，因为这些部门通常更快速地处理医院内部的问题。
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其次选择卫生行政部门 ：如果内部解决无效，再向当地的卫生行政部门投诉，他们有专业的医疗纠纷处理经验。
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最后考虑司法途径 ：如果问题严重到涉及医疗事故或严重侵权，可以考虑通过司法途径解决，如向法院提起诉讼。
希望这些信息对您有所帮助，祝您投诉顺利!
