合同制医生和编制医生在多个方面存在显著差异：
- 用工形式 ：
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编制医生 ：属于国家正式编制人员，通常与本地卫生局签订劳动合同，并由卫生局分配到具体医院工作。其个人档案在本地卫生局存档。
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合同制医生 ：与医院签订劳动合同，属于雇佣关系。其个人档案通常由医院人事部门或人力资源市场保管。
- 薪资待遇 ：
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编制医生 ：享有国家规定的各种津贴和福利，如岗位津贴、绩效奖金、年终奖、五险一金（包括较高的公积金缴纳额）、公医和住房补贴等。工资标准根据职称、学历、岗位等因素确定，且通常较为稳定。
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合同制医生 ：工资标准和福利待遇根据合同约定的条款执行，通常较低且不稳定。在经济效益不佳时，合同制医生可能面临降薪或裁员的风险。
- 职业发展 ：
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编制医生 ：可以通过考试晋升职称或调整岗位等级，职业发展较为稳定，且有较多的晋升机会。
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合同制医生 ：职业发展主要依赖于自身能力和业绩，晋升机会相对较少，且需要医院内部竞争。
- 稳定性 ：
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编制医生 ：具有较高的稳定性和保障性，因为其用工关系受到国家政策的支持和管理，基本不会被裁员或降薪。
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合同制医生 ：相对来说缺乏稳定性和保障性，用工关系更加灵活和市场化，面临较大的职业风险。
- 福利保障 ：
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编制医生 ：享有较多的福利保障，包括退休金、精神文明奖、取暖费、绩效奖金等。
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合同制医生 ：福利保障相对较少，主要依赖于医院的福利待遇制度，且可能在医院效益不佳时受到影响。
- 档案管理 ：
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编制医生 ：个人档案在本地卫生局存档。
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合同制医生 ：个人档案由医院人事部门或人力资源市场保管。
综上所述，合同制医生和编制医生在用工形式、薪资待遇、职业发展、稳定性、福利保障以及档案管理等方面存在明显差异。编制医生通常享有更高的稳定性和保障性，而合同制医生则需要在合同约定的范围内寻求职业发展和福利保障。建议在选择职业时，综合考虑个人需求、职业规划和风险承受能力。
