在手机上交农村合作医疗的流程如下：

1. 通过微信缴费 ：

• 打开微信APP，点击右下角的“我”图标，进入个人信息页面。

• 点击“支付”或“服务”选项，进入支付界面。

• 在支付界面，向下滑动屏幕，找到并点击“生活缴费”或“城市服务”选项。

• 如果未直接看到“生活缴费”或“城市服务”，可以在搜索栏输入相应关键词进行查找。

• 定位所在城市并选择医保缴费：在生活缴费或城市服务界面，自动定位或手动选择所在城市。

• 查找并点击“农村合作医疗缴费”或“城乡居民医疗保险缴费”选项。

• 输入个人信息并确认缴费：根据页面提示，输入参保人的身份证号码、姓名等个人信息。

• 确认缴费编号无误后，点击“立即缴费”或“下一步”按钮。

• 选择支付方式（如微信支付、银行卡支付等），按照提示完成支付流程。

• 查看缴费结果：支付成功后，页面将显示“缴费成功”的提示。用户可以在微信的消息通知中查看缴费结果，或返回生活缴费、城市服务界面查看缴费记录。

2. 通过支付宝缴费 ：

• 打开支付宝APP，点击“更多”或“市民中心”选项。

• 进入“社保”或“医保”界面，选择“居民医保缴费”。

• 输入个人信息并确认缴费编号，按照提示完成支付流程。

3. 通过银行APP缴费 ：

• 下载并打开所持银行卡的APP（如工商银行、农业银行等）。

• 在APP内找到并选择“社保缴费”或“医保缴费”选项。

• 输入个人信息并确认缴费编号，按照提示完成支付流程。

4. 通过保险公司官方APP缴费 ：

• 下载并注册保险公司的官方应用程序。

• 根据应用内的指引完成缴费流程。

5. 通过农村信用社服务缴费 ：

• 在一些地区，农村信用社提供农村合作医疗保险的缴费服务，可以直接到信用社进行缴费。

建议：

• 确保选择正确的缴费方式，并根据自己的实际情况选择最便捷的缴费渠道。

• 如果是首次参保或新参保，需要先携带相关证明资料前往当地社保、医保经办窗口办理新增参保登记，税务系统缴费核定之后，再定期在手机上缴纳。