合作医疗交重复了是可以退还的 。根据相关规定，如果参保人员不慎重复缴纳了医疗保险费用，需要主动采取措施进行处理。具体退款流程如下：
- 通过12366纳税服务应用咨询 ：
-
打开12366纳税服务应用。
-
点击右上角的登录选项，登录成功后，选择自己的所在城市。
-
点击咨询选项，选择在线咨询进入。
-
根据提示信息点击确定按钮，接通在线客服后，对客服进行询问。
-
根据客服所回复的信息，准备相关资料去办税大厅办理退费即可。
- 向医保所居民医保窗口申请 ：
-
申请人至医保所居民医保窗口提出申请，提供相关资料。
-
填写《城镇居民基本医疗保险退保申请表》。
-
经办人员核对参保人基本信息，审核退保资格，符合条件的给予医保退保，出具《城镇居民基本医疗保险退款通知单》。
-
申请人凭《退款通知单》至财务结算窗口办理医保退费手续。
- 携带相关材料到医保中心窗口办理 ：
-
携带身份证、银行卡、缴费凭证等材料到医保中心窗口办理城乡医保退费申请。
-
规定是采取预缴费方式的城乡居民医保参保人，在城乡居民医保待遇享受期生效前已经参加其他基本医保的，可依法申请退费。
综上所述，重复交纳的医疗保险费用不会自动返还，参保人员需要按照相关程序和规定申请退费。建议参保人员及时咨询当地医保部门或通过官方渠道了解具体的退款流程和所需材料，以确保能够顺利完成退费操作。