社保停了是可以缴纳农村医保的 。社保转新农合属于高转低，即当月缴纳新农合费用次月享受新农合待遇，以后缴费是一年一度，终身缴费。首先需要停掉社保，并且携带原单位参保的社保局开具缴费凭证，以及本人身份证、户口本回户籍所在地，直接去乡镇社保所办理参保即可。但是需要注意的是，职工医保和新农合医保享受的待遇有所不同，职工医保报销比例比农村医保要高。因此，建议可以先挂靠到公司名下继续缴纳社保，或者尽快找到新工作将医保续上。
此外，有社保退休了还需要交农村合作医疗。大部分地区已经将新农合与城镇居民医保合并成了城乡居民基本医疗保险，其中趁着居民医疗保险退休以后仍旧可以享受医保待遇，但新农合退休以后仍旧需要按照规定继续缴纳医保，才可以享受医保报销待遇。
综上所述，如果你已经参加了社保，建议继续缴纳社保，因为社保的保障更全面，医疗报销更有优势。如果你选择退掉社保，转而购买农村医疗保险，也需要注意以下几点：
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社保和农村医保不能重复报销，报销时只能选一个。
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农村医疗保险通常只有农业户口才可以购买。
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农村医疗保险的缴费通常是一年一度，需要按时缴纳。
因此，在做出选择之前，建议仔细了解相关政策，并根据自身情况做出合理决策。