社保中的医疗保险与农村合作医疗保险（新农合）之间存在以下主要区别：
- 参保对象 ：
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社保 ：主要针对城镇职工和城镇居民，包括在职职工、灵活就业人员以及没有正式工作的城镇居民等。
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新农合 ：主要针对农村户口的居民，只有拥有农村户口的人才可以参加。
- 缴费方式 ：
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社保 ：由用人单位和职工共同缴纳，按照规定的缴费基数和比例缴纳，通常按月缴纳。
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新农合 ：由个人、集体和政府多方筹资，农民自愿参加，每年交一次费用。
- 保障期限 ：
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社保 ：医疗保险要求持续缴纳最少15年才可以享受终身医保待遇。
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新农合 ：是一年一交费，一年一参合，只能在当年享受报销。
- 报销比例 ：
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社保 ：报销比例较高，通常在70%至80%之间，且住院费用报销比例一般达80%以上。
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新农合 ：报销比例相对较低，通常在50%至70%之间，异地报销比例可能更低，仅为30%至40%。
- 账户设立 ：
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社保 ：有个人医保账户，可以在指定医疗机构刷卡使用。
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新农合 ：没有个人医保账户，报销金额直接补贴到医疗机构。
- 使用范围 ：
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社保 ：不仅涵盖住院费用，还可以用于挂号、看病就医、药店买药等。
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新农合 ：目前主要是住院费用报销，少部分城市看病就诊也能报销。
- 管理机构 ：
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社保 ：由社保系统管理，属于国家层面的社会保障制度。
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新农合 ：由卫生局管理，属于地方层面的政策。
综上所述，社保中的医疗保险与农村合作医疗保险在参保对象、缴费方式、保障期限、报销比例、账户设立、使用范围和管理机构等方面均有显著差异。建议根据自身情况选择合适的保险类型，以确保获得充分和适当的医疗保障。
