云南昆明治疗基质性角膜炎较好的医院包括昆明医科大学第一附属医院、云南省第一人民医院等三甲综合医院，以及云南省传染病专科医院等专科机构，这些医院凭借先进的设施和丰富的临床经验成为当地首选。
三甲综合医院优势突出
昆明医科大学第一附属医院作为省内顶级综合医院，拥有5个国家级重点专科和24个省级重点专科，眼科诊疗技术成熟；云南省第一人民医院（昆华医院）是疑难危重疾病救治中心，依托多院区协作提供高效服务。专科医院针对性更强
云南省传染病专科医院虽以传染病为主，但眼科配套设施完善，尤其对复杂角膜炎病例有独特经验；普洱市人民医院作为地州龙头，眼科手术能力突出，适合周边地区患者就近就医。选择建议
急重症或复杂病例建议优先考虑三甲综合医院，其多学科协作能力更强；若需长期治疗或合并其他感染，专科医院的精细化诊疗更具优势。
昆明医疗资源集中，患者可根据病情轻重、交通便利性综合评估，早期规范治疗是改善预后的关键。