西安市第三医院是一所三级甲等综合医院，擅长多个领域的疾病诊治，以下是一些主要的优势学科和擅长领域：
心血管内科
心血管内科一病区：是市重点专科，擅长心血管疾病的介入诊断和治疗，对疑难杂症、难治性心衰、顽固性高血压等有独到见解。
心血管内科二病区、三病区：在心血管疾病的临床、科研和教学方面有丰富经验，能够处理各种复杂心血管疾病。
神经内科
神经内科：是省重点专科，擅长重症脑血管病、神经危重症、神经遗传及退行性疾病的诊断及治疗，开展了急性脑梗死超早期动脉药物溶栓、机械碎栓、闭塞血管重建、血管成形术等技术。
消化内科
消化内科：由第四军医大学唐都医院消化内科团队和西安市中心医院消化内科团队联合组成，技术力量雄厚，擅长消化系统疾病的诊治，尤其是消化内镜下的微创治疗。
普通外科
普外科一病区：是医院的重点学科之一，擅长肝脏、胆道、胰腺、胃肠、肛肠、血管疾病、甲状腺和乳腺的肿瘤及外伤等疾病的手术治疗，微创技术是其特色和优势。
普外科二病区（肝胆胰脾外科）：在治疗胰腺肿瘤、急慢性胰腺炎、肝门胆管癌等方面有丰富经验，开展了多种高难度的复杂外科手术。
妇产科
妇产科：是集妇科、产科、计划生育、教研与临床为一体的综合性临床科室，擅长各种妇科常见病及多发病的诊治，同时开展青少年、老年妇女保健咨询、讲座，计划生育咨询，指导宫颈癌普查等服务。
骨科
骨科：在骨关节疾病、脊柱疾病、创伤骨科等方面有较强的技术实力，开展了多项骨科手术，如关节镜手术、脊柱手术等。
口腔科
口腔科：作为西安市口腔医院，擅长口腔颌面外科、牙体牙髓病、牙周病、口腔修复、口腔正畸等疾病的诊治，拥有先进的口腔医疗设备。
其他优势领域
重症医学科：是省级临床重点专科，擅长急危重症患者的救治，具备先进的重症监护设备和技术。
泌尿外科：是省级临床重点专科建设项目，擅长泌尿系统疾病的微创治疗和复杂手术。
呼吸与危重症医学科：是集医疗、教学、科研、预防、康复为一体的综合性临床学科，擅长呼吸系统疾病的诊治和危重症患者的救治。
