两只眼睛双眼皮不对称可根据不同情况处理。若是刚做完双眼皮手术短期内不对称，可先观察等待恢复；因不良习惯导致的，可改善习惯；若是眼部疾病引起，需治疗疾病；若长期不对称且影响美观，可考虑手术修复。

1. 术后观察：刚做完双眼皮手术，短期内不对称是常见现象，一般3 - 6个月可恢复，在此期间要做好护理，耐心等待。

2. 改善习惯：长期单侧用眼、侧卧等不良习惯可能导致不对称，要保持良好用眼和睡眠习惯，避免长时间单侧用眼。

3. 治疗疾病：眼部疾病如眼睑下垂、麦粒肿等也会造成不对称，应及时就医，积极治疗疾病。

4. 手术修复：若恢复后仍不对称，或天生不对称且影响美观，可在专业医生评估后，进行手术修复，如双眼皮修复术。

两只眼睛双眼皮不对称不必过于焦虑，要区分不同原因。术后短期不对称可先等待，因习惯导致的改善习惯，疾病引起的治疗疾病，长期影响美观的可手术修复。但手术有风险，需选择正规医疗机构和专业医生。