大姨妈结束还有褐色分泌物一般情况下是宫腔或者是阴道残存的积血，属于正常的生理现象。在月经干净3~7天后，随着体位的改变或者是分泌物的排出，会完全干净，不需要进行特殊处理。
但是如果月经干净后3~7天以后，还有褐色分泌物，也不排除病理性的原因造成，比如子宫内膜息肉、子宫内膜增生症等，都会造成月经干净后有褐色分泌物的情况。
所以如果是月经干净后出现褐色分泌物的时间比较长，超过一周以上。建议及时行彩超检查，了解子宫附件以及内膜的情况，根据检查结果，对症的给予有效的处理。
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