棘阿米巴角膜炎的治疗主要有两大方面:第一,抗阿米巴药物治疗。抗阿米巴的药物主要有阳离子抑制剂,比如双氯苯双胍己烷;抗真菌的药物,比如钠他霉素或者氟康唑滴眼液;严重的患者可以使用甲硝唑注射液、静脉点滴或口服。
第二,对于比较严重的棘阿米巴角膜炎病人,需要手术治疗。溃疡不是很深的可以采用羊膜移植或结膜瓣遮盖手术;病灶比较深的可能需要做病灶清除,然后做板层的角膜移植;更加严重的,甚至发生角膜溃疡穿孔的病人可能需要做穿透角膜移植。无论是哪种手术,术后仍然要积极的抗阿米巴治疗,有的患者需要治疗长达四个月甚至半年、一年以上。