十二指肠溃疡的临床表现以胃脘部疼痛为主，疼痛的强度随着个人的体质不同而变化，一般是轻度和中度的疼痛，呈节律性、周期性的发作。疼痛以空腹痛、夜间痛为主，有的患者夜间疼痛比较重，常常可以疼醒。节律性疼痛由于溃疡的存在而一直发生，有发作性、缓慢性和节律性的规律。
疼痛的性质表现为钝痛、灼痛、胀痛，甚至有剧烈的刀割样疼痛，服用抑酸剂或保护胃粘膜的药物后缓解，抑酸剂主要是指PPI类，比如奥美拉唑、泮托拉唑等。病人疼痛发作时，主要位在剑突下、上腹部，有的患者表现为右上腹的局限性疼痛，缓解后无明显的感觉。
有些患者的疼痛不典型，尤其是老年人反应不敏感，表现为上腹部的胀满、不适、纳差、嗳气、反酸等不良表现。部分消化道溃疡没有发生疼痛或纳差，直接以消化道溃疡的并发症为首发症状，比如消化道的出血、穿孔，如果存在以上并发症，建议及时前往医院就诊。
