白细胞减少症的原因非常之多，临床上大部分人不好找到一个明确的原因。但是也有相当一部分人，如果是由于某些疾病继发来的，是很清楚的。那么常见的原因可以归纳来说：第一个原因，病毒感染，这个病毒包括呼吸道病毒，呼吸道感染还有感冒咳嗽，肝炎病毒像肝硬化、乙型肝炎、丙型肝炎，还有EB病毒感染；第二个原因，药物，像服了消炎药、止疼药，使用了抗癌药，会引起白细胞减少；第三个原因，免疫破坏，像类风湿性关节炎、红斑狼疮，通常会有白细胞减少；第四个原因，血液病，像再生障碍性贫血、白血病，对骨髓里面破坏，导致正常的白细胞减少；第五个原因，一些其他器官的疾病，比如严重的细菌感染；第六个原因，一些白细胞减少可能是分布方面的问题，比如说白细胞分布在血管壁上，叫做假性白细胞减少症，实际上细胞的总数并不减少。
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