根据前列腺炎的分型，药物治疗要点如下：
一型的急性细菌性的前列腺炎，即刻注射广谱抗菌药迅速控制炎症。常用的抗菌药包括广谱的青霉素、三代头孢、氨基甙类抗生素和喹诺酮类抗生素，在获得细菌培养结果以后再选择针对性的、更强敏感性的抗菌药物静脉注射治疗。待发热症状改善以后，可以改为口服的抗菌药物治疗，可以联合用药或者交替用药以防止耐药性。抗菌药应根据医嘱使用，足量、足疗程，避免滥用。
二型的慢性细菌性前列腺炎，根据细菌培养的结果和药敏实验，选择敏感抗菌药物控制炎症。常用的抗菌药包括左氧氟沙星、阿奇霉素、多西环霉素等等。口服α-受体阻滞剂比如盐酸坦索罗辛、多沙唑嗪，一般是6~12周，可以改善疼痛和排尿症状，治疗中应该注意该类药物导致的眩晕、体位性低血压等不良反应。非甾体类的抗炎药为经验性用药，有助于改善疼痛和不适症状。伴有膀胱过度活动症表现，而且没有尿路梗阻的患者，可以考虑使用M-受体阻滞剂如托特罗定、索利那新来改善排尿的症状。
三型的是慢性前列腺炎和慢性盆腔疼痛综合征，口服α-受体阻滞剂比方说坦索罗辛6~12周，可以改善梗阻性的排尿症状和疼痛症状。植物用药包括锯叶棕果实提取物6~12周，改善疼痛和排尿的症状。伴有膀胱过度活动症表现且无尿路梗阻的患者，可以使用M-受体阻滞剂如索利那新等这一类的药物来改善排尿症状。抑郁、焦虑、慢性疲劳综合症等神经系统症状，可以使用抗抑郁、抗焦虑之类的药物来进行治疗。非甾体类的抗炎药，有助于改善疼痛和不适的症状。此外，对于三型前列腺炎进行进一步的分型以后，治疗方案会有所区别。三型A类的是指炎症性的慢性骨盆疼痛综合征，前列腺液、精液、前列腺按摩以后，尿液当中镜检白细胞数量增加，可经验性地口服喹诺酮类的抗菌药物2~4周，如果症状减轻可继续使用，总疗程4~6周。如果经全疗程治疗仍然失败，除非患者确实有尿路感染，否则不应该再使用抗菌性的药物。三型B类的不推荐使用抗生素药物治疗。
四型的前列腺炎属于无症状的前列腺炎，一般无需特殊处理。如果合并有不育症或者是血清前列腺特异抗原PSA升高的话，可以参照三型前列腺炎治疗方法。
