PET-CT中CT仅用于定位PET所发现的异常(非诊断性扫描)。因此用低剂量模式，辐射剂量低(例如，一次全身扫描为7mSv)。如用高分辨率的诊断扫描，剂量可能相当高（一次全身扫描达30mSv)。PET取决于注入的18F-FDG的活性，无论是全身还是部分扫描，成年人通常是8mSv。因此通过修改CT采集参数可以显著降低PET-CT扫描的辐射剂量。
X射线辐射（电离辐射），而且辐射强度很大！随着X射线及CT扫描技术的应用发展，X射线及CT检查已经成为医用检查的常用手段，但在大量应用的同时，也加大了电离辐射（放射源）对人体的危害。
X射线辐射（电离辐射），而且辐射强度很大！随着X射线及CT扫描技术的应用发展，X射线及CT检查已经成为医用检查的常用手段，但在大量应用的同时，也加大了电离辐射（放射源）对人体的危害。
CT扫描结束后，X射线不会残存体内。18F-FDG的半衰期是105-115分钟，患者第二天体表的辐射水平已经接近天然本底水平，因此对公众影响很小。