云南丽江社保基数20400元扣税金额需根据实际应纳税所得额计算，关键影响因素包括：社保公积金个人缴纳部分、专项附加扣除及个税起征点（5000元/月）。

1. 计算应纳税所得额
   首先从工资中扣除社保和公积金个人部分（以丽江当地比例为准，如养老保险8%、医疗保险2%等），再减去5000元起征点及符合条件的专项附加扣除（如子女教育、房贷利息等）。公式为：
   应纳税所得额 = 20400 - 社保公积金个人缴纳 - 5000 - 专项附加扣除

2. 适用税率与速算扣除数
   根据超额累进税率表，应纳税所得额对应3%-45%的税率。例如：

   • 若扣除后所得额为3000元，按3%税率需缴税90元；
   • 若扣除后为12000元，则按10%税率减去速算扣除数210元，实缴990元。

3. 实际案例参考
   假设社保公积金个人缴纳合计3000元，专项附加扣除2000元，则：
   20400 - 3000 - 5000 - 2000 = 10400元，适用10%税率，最终个税为10400×10% - 210 = 830元/月。

提示： 具体金额需结合个人实际社保缴纳比例及专项扣除情况，建议使用个税计算器或咨询当地税务部门获取精准结果。