安徽宣城社保基数9900元和5000元的区别主要体现在缴费金额、待遇水平以及个人和单位的负担上。 社保基数是计算社保缴费的重要依据，基数越高，缴费越多，相应的待遇也越高。以下是具体的区别：

1. 1.缴费金额的差异：高基数（9900元）：以9900元为基数计算社保缴费，个人和单位的缴费金额都会相应增加。例如，养老保险个人缴费比例为8%，则个人每月需缴纳792元；单位缴费比例通常为16%，则单位需缴纳1584元。低基数（5000元）：以5000元为基数计算，个人每月需缴纳400元养老保险，单位需缴纳800元。高基数情况下，个人和单位的缴费金额都显著高于低基数。
2. 2.待遇水平的不同：养老金：社保基数越高，退休后领取的养老金也越多。养老金计算公式中，缴费基数是重要因素之一。高基数（9900元）缴费的职工，退休后每月领取的养老金将明显高于低基数（5000元）缴费的职工。医疗保险：高基数缴费的职工，其医保个人账户的累计金额也会更多，医疗报销比例和上限也可能更高。这意味着在就医时，高基数缴费的职工能够享受更高的报销额度。失业保险和工伤保险：缴费基数越高，失业期间领取的失业金和工伤赔偿金额也会相应增加。
3. 3.个人和单位的负担：个人负担：高基数缴费意味着个人每月从工资中扣除的社保费用更多，这可能会对个人可支配收入产生一定影响。对于收入较高的职工来说，这种影响相对较小；而对于收入较低的职工，可能会感到一定的经济压力。单位负担：单位需要为员工缴纳的社保费用也随基数增加而增加。高基数（9900元）情况下，单位的社保支出将显著高于低基数（5000元）情况。这可能会影响单位的用人成本和利润空间。
4. 4.其他影响：住房公积金：社保基数通常与住房公积金缴费基数挂钩。高基数缴费的职工，其住房公积金个人和单位缴存金额也会更高，购房时能够积累更多的住房储蓄。生育保险：高基数缴费的职工，在生育期间能够享受更高的生育津贴和医疗报销待遇。

安徽宣城社保基数9900元和5000元的区别主要体现在缴费金额和待遇水平上。高基数缴费意味着更高的缴费金额，但同时也带来了更高的社保待遇和更好的保障。对于个人和单位而言，选择合适的社保基数需要综合考虑收入水平、用人成本以及未来的保障需求。