医保个人支付金额的扣除方式取决于具体的支付场景，主要分为以下几种情况：

一、门诊就医个人支付

1. 普通门诊

   在定点医疗机构使用医保卡支付门诊费用时，系统会自动从医保个人账户中扣除自付部分（如起付线以下金额、超过起付线后的自费比例等）。

2. 药店购药

   通过医保系统结算时，系统会计算个人自付金额，医保基金支付报销金额，个人支付部分直接从医保个人账户扣除。

二、住院医疗费用支付

1. 自费部分

   住院时产生的自费金额（如起付线以下、超过起付线后的自费比例等）由患者本人或家属直接支付，医保统筹基金支付报销部分。

2. 大额医疗费用

   对于超过统筹基金支付限额的医疗费用，可能涉及个人账户余额的二次支付（如大额医疗费用的15%自付比例）。

三、其他特殊情况

1. 电子凭证支付

   使用支付宝等平台时，医保支付会优先扣除医保个人账户余额；若余额不足，则从绑定的银行卡中扣除。

2. 账户余额不足处理

   当医保个人账户余额为0时，系统仍会尝试从统筹账户中支付，但需符合当地医保政策规定。

四、注意事项

• 账户类型差异 ：职工医保个人账户按缴费基数比例划入（如35岁以下3.0%），退休人员按4%划入；居民医保个人账户则无统筹资金划入，仅限个人缴费部分。

• 年度结转 ：个人账户余额可结转下一年度使用，但仅限门诊和药店购药，住院费用需自费。

以上规则适用于城镇职工医保和城乡居民医保，具体比例和起付线标准因地区而异，建议参保人员咨询当地医保部门获取详细信息。