农村合作医疗核磁和CT报销比例一般为40%-70%，具体数额根据当地政策和医院级别有所差异。

1. 核磁共振（MRI）报销

核磁共振作为一种高精度的医学影像检查，其费用通常高于CT。农村合作医疗对核磁共振的报销比例一般为40%-60%。例如，一次核磁共振检查的费用为1000元，报销比例为50%时，患者实际支付的费用为500元。

2. CT扫描报销

CT扫描的报销比例通常略高于核磁共振，范围在50%-70%之间。具体报销比例取决于CT检查的类型和医院的级别。例如，一次CT扫描的费用为800元，报销比例为60%时，患者实际支付的费用为320元。

3. 地区政策差异

农村合作医疗的报销政策因地区而异，不同地区的报销比例和报销限额可能有所不同。患者在进行核磁或CT检查前，应咨询当地农村合作医疗管理部门或就医医院，以获取准确的报销信息。

4. 医院级别影响

报销比例还受到医院级别的影响。通常情况下，乡镇卫生院的报销比例较高，而市级或省级医院的报销比例相对较低。患者在选择就医医院时，应综合考虑医疗水平和报销政策。

5. 其他费用

除了检查费用本身，患者还需注意其他可能产生的费用，如挂号费、诊疗费等。这些费用也可能纳入农村合作医疗的报销范围，但具体报销比例和限额需要根据当地政策确定。

通过了解核磁和CT检查的农村合作医疗报销政策，患者可以更好地规划医疗费用，减轻经济负担。在进行检查前，建议患者详细咨询相关部门或医院，以获取准确的信息。