低保户住院二次报销比例根据医疗保障政策和地区差异有所不同，主要分为以下几种情况：

一、基本医疗保障报销比例

1. 城乡居民基本医疗保险

   • 乡镇卫生院：80%-90%

   • 县级医院：70%-80%

   • 市级及以上医院：60%-70%

2. 大病保险报销比例

   • 在基本医疗保险报销后，个人自付部分超过起付线的，可享受大病保险二次报销，比例通常为60%-80%

二、二次报销比例

1. 民政救助比例

   • 全年住院医疗总费用超过4万元时，民政救助比例一般为80%

   • 部分地区（如贵阳）可能更高，例如65%

2. 慈善总会救助比例

   • 在民政救助基础上，慈善总会可能再救助20%

   • 具体比例需根据当地政策或慈善项目确定

三、其他注意事项

1. 报销顺序

   • 遵循“先保险，后救助”原则，先通过医保、大病保险报销，余下部分申请医疗救助

   • 民政救助与慈善总会救助通常无先后限制，可叠加申请

2. 起付标准与限额

   • 不同地区对起付线、最高支付限额等有具体规定，例如：

     • 居民医保起付标准1.4万元（普通人群），低保等特殊人群7000元

     • 最高支付限额40万元

3. 政策差异

   • 上述比例和标准可能因地区政策不同存在差异，建议参保人咨询当地医保部门

四、申请流程

1. 准备相关材料（如低保证、医疗费用发票等）

2. 向医保部门提交首次报销申请

3. 自付部分超过起付线后，申请大病保险二次报销

4. 二次报销申请通过后，民政和慈善总会按比例补助

以上信息综合了全国及部分地区的政策，具体以参保地最新规定为准。