根据南京市医保政策规定，医保中断3个月后再缴纳医疗保险待遇的恢复时间如下：

一、连续缴费满3个月内的处理方式

1. 视为连续参保

   若中断时间不超过3个月且按时足额补缴医疗保险费，系统将视作连续参保，缴费年限连续累计计算，期间发生的医疗费用可按规定享受职工医保待遇。

2. 次月恢复待遇

   补缴后次月即可正常享受医保报销待遇，中断期间的待遇可追溯享受。

二、超过3个月后的处理方式

1. 重新参保并设置等待期

   若中断超过3个月，需重新参保并设置2个月待遇享受等待期，自补缴到账次日起开始缴费，连续缴费满6个月后才能重新享受医保统筹待遇。

2. 特殊情况说明

   • 若中断超过6个月，需连续缴费满1年后才能恢复医保待遇。

   • 个人账户余额在断缴期间不享受统筹报销，但可继续使用。

三、注意事项

• 地区政策差异 ：不同城市对医保断缴后的处理规则可能略有不同，建议续缴后通过当地医保部门或官方APP（如“我的南京”）确认具体生效时间。

• 缴费基数影响 ：重新参保后，缴费基数可能按当地最低档或原缴费基数执行，影响报销比例。

建议医保断缴后尽快补缴，并联系当地医保部门确认具体流程及待遇恢复时间，避免影响医疗保障权益。