国家医保局作为我国医疗保障领域的核心管理部门，其下设部门设置需结合不同时期的政策调整和职能需求。根据最新官方信息，其部门设置如下：

一、主要组成部门

1. 办公室

   负责机关日常运转、安全保密、信访处理及政务公开等工作。

2. 基本医疗保险司

   主导基本医疗保险政策制定、基金监管及“三保合一”后的政策实施。

3. 协议及法规司

   负责医保协议管理、法规起草及合规性审核。

4. 内控监管司

   承担医保基金风险防控、信用评价及信息披露制度建立。

5. 信息中心/清算中心

   负责医保信息化建设、数据统计分析及基金清算工作。

6. 经办中心

   承担医保待遇审核、医疗费用结算及参保服务管理。

7. 医疗保险研究室

   负责医保政策研究、评估及改革方案制定。

二、其他说明

• 历史调整 ：早期资料显示医保局曾设7个部门（如待遇保障司、医药服务管理司等），但根据近年职能整合，部门数量和名称有所调整。

• 地方机构差异 ：市医保局等地方机构可能根据辖区实际情况设置5-7个科室，如法规与监督科、医药价格与招标采购科等。

• 职能交叉 ：部分部门存在职能交叉现象，例如基金监管与内控监管司在基金安全防控方面有协同职责。

以上信息综合了国家医保局官网及权威媒体报道，反映了近年机构改革后的主要架构。如需具体部门职责或最新调整，建议访问国家医保局官网查询。