​​中药未纳入医保的核心原因是其疗效和安全性缺乏国际公认的科学验证标准，且成本效益比不如西药明确。​​ 国内医保报销以循证医学为基础，而中药的个体化治疗特点与医保的标准化评估体系存在矛盾，同时部分中药存在原材料稀缺、价格波动大等现实问题。

中药的疗效评价体系与西医存在本质差异。西药通过大规模双盲试验验证，而中药强调辨证施治，难以用统一标准量化效果。这种差异导致中药难以满足医保对药物“明确适应症”和“可重复疗效”的硬性要求。部分经典方剂虽历史悠久，但缺乏现代临床数据支撑，例如某些含毒性药材的复方制剂可能引发肝肾损伤争议。

医保基金控费压力促使报销目录优先纳入高性价比药物。西药专利过期后仿制药价格大幅下降，而中药因炮制工艺复杂、野生药材成本高等原因，难以通过集中采购压价。部分名贵药材如天然牛黄、野山参等资源日益枯竭，若纳入医保可能加剧基金透支风险，这与医保“保基本”的原则相冲突。

中药标准化生产仍是行业难题。同方不同效现象普遍存在，药材产地、炮制方法差异直接影响药效，不符合医保对药品质量均一性的要求。中药注射剂等剂型曾因不良反应频发引发关注，进一步加剧监管审慎态度。相比之下，西药化学成分明确、质量控制体系成熟，更符合医保的风险管控需求。

未来中药纳入医保需要突破三大瓶颈：建立符合中医理论又能被现代医学认可的疗效评价标准，解决原材料供应和价格稳定性问题，以及通过真实世界研究补充临床数据。现阶段部分地区已试点将针灸等中医适宜技术纳入医保，为中药报销积累经验。