根据我国医疗保障政策，关于公司缴纳的医保与老家合作医疗的报销问题，综合权威信息说明如下：

一、政策规定层面

1. 职工医保与居民医保（新农合）不可同时参保

   根据《人力资源和社会保障部卫生部财政部关于印发流动就业人员基本医疗保障关系转移接续暂行办法的通知》（人社部发〔2009〕191号），职工医保和居民医保属于两种不同的医疗保险制度，参保人员不得同时参加，否则视为重复参保，需取消其中一种。

2. 重复参保的后果

   若同时缴纳社保和新农合，医疗费用将无法同时报销，需选择其中一种报销方式。

二、实际操作层面

1. 单位缴纳的医保优先级更高

   若单位已为其缴纳职工医保，个人无需再缴纳新农合。职工医保的报销范围、比例通常高于新农合，建议选择职工医保以获得更全面的保障。

2. 异地就医报销限制

   即使在不同地区缴纳医保，报销时仍需遵循“先参保先用”的原则。例如，某地医保规定外地就医需先使用当地医保报销，剩余部分再通过其他渠道解决。

3. 报销流程冲突

   若已通过职工医保报销，老家新农合将无法再报销同一笔费用，反之亦然。部分地区的医保系统可能通过信息共享避免重复报销，但具体操作需以当地政策为准。

三、建议方案

1. 取消老家新农合

   若单位已缴纳职工医保，建议停缴新农合，避免重复参保和报销冲突。

2. 保留商业医疗保险

   可选择购买商业医疗保险作为补充，部分产品可凭复印件报销，降低医疗支出风险。

3. 异地就医处理

   若在异地就医，需提前了解当地医保政策，优先使用当地医保报销，再通过其他渠道解决差额部分。

在单位缴纳医保后，老家合作医疗将无法同时报销，需根据实际情况选择保障方案。