生育津贴的发放与五险一金的扣除方式需根据具体情况区分，具体说明如下：

一、生育津贴与五险一金的关系

1. 生育津贴的发放基础

   生育津贴是用人单位按职工所在单位上年度职工月平均工资计发，用于保障女职工生育期间的基本生活。 其计算公式为： $$\text{生育津贴} = \frac{\text{用人单位上年度职工月平均工资}}{\text{30天}} \times \text{实际产假天数}$$

   该金额通常高于或等于职工产假前工资（含五险一金）。

2. 五险一金的缴纳与扣除

   • 若用人单位已为职工缴纳生育保险， 生育津贴不会直接扣除五险一金 。单位在申领生育津贴时，会从应发工资中扣除职工个人承担的五险一金部分，剩余部分作为生育津贴发放。

   • 若单位未缴纳生育保险，则无法申领生育津贴，职工应享受产假工资（通常为职工本人工资）。

二、实际操作中的关键点

1. 工资发放流程

   • 单位在产假期间无需向职工发放工资，而是代扣五险一金后，以生育津贴替代原工资发放。

   • 若单位直接发放现金工资，则需从现金中扣除个人五险一金部分。

2. 特殊情况处理

   • 若生育津贴低于职工本人工资，单位需补足差额。

   • 若单位未按时缴纳生育保险，可能影响津贴金额或领取时间，但不会直接扣除已缴社保。

三、总结

生育津贴的发放与五险一金的扣除需结合单位是否依法缴纳生育保险及工资发放方式综合判断。一般情况下，生育津贴不会直接扣除五险一金，而是通过工资替代形式发放。若存在疑问，建议咨询当地社保部门或劳动仲裁机构。